MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV3

Total Repeats: 1246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015179	CGTC	2	8	43072	43079	0 %	25 %	25 %	50 %	325113322
1002	NC_015179	GA	3	6	43123	43128	50 %	0 %	50 %	0 %	325113322
1003	NC_015179	TTG	2	6	43140	43145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113322
1004	NC_015179	CAA	2	6	43188	43193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325113322
1005	NC_015179	TGC	2	6	43261	43266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113322
1006	NC_015179	AGA	2	6	43279	43284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113322
1007	NC_015179	TGC	2	6	43314	43319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015179	AGT	2	6	43405	43410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113323
1009	NC_015179	CG	3	6	43432	43437	0 %	0 %	50 %	50 %	325113323
1010	NC_015179	GCG	2	6	43478	43483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113323
1011	NC_015179	CTC	2	6	43495	43500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113323
1012	NC_015179	GCT	2	6	43503	43508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113323
1013	NC_015179	CGTG	2	8	43533	43540	0 %	25 %	50 %	25 %	325113323
1014	NC_015179	CGC	2	6	43613	43618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113323
1015	NC_015179	GAC	2	6	43667	43672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113323
1016	NC_015179	CG	3	6	43741	43746	0 %	0 %	50 %	50 %	325113323
1017	NC_015179	CCG	2	6	43866	43871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113323
1018	NC_015179	T	7	7	43882	43888	0 %	100 %	0 %	0 %	325113323
1019	NC_015179	AGC	2	6	43996	44001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015179	CGG	2	6	44071	44076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015179	TCT	2	6	44126	44131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325113324
1022	NC_015179	ACC	2	6	44336	44341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_015179	AC	3	6	44365	44370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_015179	CCGGAT	2	12	44565	44576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015179	ATG	2	6	44585	44590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015179	CGA	2	6	44634	44639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015179	GAT	2	6	44640	44645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015179	ACG	2	6	44668	44673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015179	CCCG	2	8	44675	44682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1030	NC_015179	CAG	2	6	44683	44688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015179	ATG	2	6	44735	44740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015179	GGC	2	6	44744	44749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015179	GCC	2	6	44860	44865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113325
1034	NC_015179	ATC	2	6	44866	44871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113325
1035	NC_015179	CGG	2	6	44876	44881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113325
1036	NC_015179	GC	3	6	44939	44944	0 %	0 %	50 %	50 %	325113325
1037	NC_015179	TGCCAG	2	12	44996	45007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325113325
1038	NC_015179	CTG	2	6	45019	45024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113325
1039	NC_015179	ACG	2	6	45126	45131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113325
1040	NC_015179	GCC	2	6	45140	45145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113325
1041	NC_015179	A	6	6	45218	45223	100 %	0 %	0 %	0 %	325113325
1042	NC_015179	AGGC	2	8	45234	45241	25 %	0 %	50 %	25 %	325113325
1043	NC_015179	TTCGCG	2	12	45262	45273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113325
1044	NC_015179	GAA	2	6	45291	45296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113325
1045	NC_015179	TCG	2	6	45300	45305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113325
1046	NC_015179	CGC	2	6	45321	45326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113325
1047	NC_015179	GAT	2	6	45330	45335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113325
1048	NC_015179	TTG	2	6	45367	45372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113326
1049	NC_015179	GCC	2	6	45375	45380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113326
1050	NC_015179	TAG	2	6	45457	45462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113326
1051	NC_015179	CCG	2	6	45487	45492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113326
1052	NC_015179	ATC	2	6	45501	45506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113326
1053	NC_015179	CG	3	6	45524	45529	0 %	0 %	50 %	50 %	325113326
1054	NC_015179	GTG	2	6	45565	45570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113326
1055	NC_015179	TCG	2	6	45571	45576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113326
1056	NC_015179	GC	3	6	45585	45590	0 %	0 %	50 %	50 %	325113326
1057	NC_015179	TGC	2	6	45751	45756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113327
1058	NC_015179	CTG	2	6	45772	45777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113327
1059	NC_015179	CGC	2	6	45821	45826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113327
1060	NC_015179	CGA	2	6	45831	45836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113327
1061	NC_015179	GCCGG	2	10	45866	45875	0 %	0 %	60 %	40 %	325113327
1062	NC_015179	GAATT	2	10	45893	45902	40 %	40 %	20 %	0 %	325113327
1063	NC_015179	CGT	2	6	45936	45941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113327
1064	NC_015179	CCG	2	6	45960	45965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113327
1065	NC_015179	CCAG	2	8	46032	46039	25 %	0 %	25 %	50 %	325113327
1066	NC_015179	GCG	2	6	46174	46179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113327
1067	NC_015179	TGA	2	6	46191	46196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113327
1068	NC_015179	AGC	2	6	46197	46202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113327
1069	NC_015179	G	7	7	46250	46256	0 %	0 %	100 %	0 %	325113327
1070	NC_015179	TGC	2	6	46370	46375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113327
1071	NC_015179	TCC	2	6	46382	46387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113327
1072	NC_015179	GGA	2	6	46400	46405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113327
1073	NC_015179	C	6	6	46420	46425	0 %	0 %	0 %	100 %	325113328
1074	NC_015179	GGC	2	6	46430	46435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113328
1075	NC_015179	GCG	2	6	46436	46441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113328
1076	NC_015179	GCA	2	6	46460	46465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113328
1077	NC_015179	GCGT	2	8	46500	46507	0 %	25 %	50 %	25 %	325113328
1078	NC_015179	GCCG	2	8	46688	46695	0 %	0 %	50 %	50 %	325113328
1079	NC_015179	TGA	2	6	46736	46741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113328
1080	NC_015179	CAT	2	6	46800	46805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113328
1081	NC_015179	GCCG	2	8	46816	46823	0 %	0 %	50 %	50 %	325113328
1082	NC_015179	CCA	2	6	46853	46858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113328
1083	NC_015179	TCA	2	6	46877	46882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113328
1084	NC_015179	CAC	2	6	46890	46895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113328
1085	NC_015179	AGGCA	2	10	46926	46935	40 %	0 %	40 %	20 %	325113328
1086	NC_015179	TGG	2	6	46955	46960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113328
1087	NC_015179	CTTC	2	8	46979	46986	0 %	50 %	0 %	50 %	325113328
1088	NC_015179	AGT	2	6	47018	47023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113328
1089	NC_015179	CGC	2	6	47043	47048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113328
1090	NC_015179	TCG	2	6	47065	47070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113328
1091	NC_015179	CCA	2	6	47207	47212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015179	GGC	2	6	47222	47227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113329
1093	NC_015179	ACG	2	6	47291	47296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113329
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1095	NC_015179	CG	3	6	47394	47399	0 %	0 %	50 %	50 %	325113329
1096	NC_015179	GAT	2	6	47504	47509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113330
1097	NC_015179	CAC	2	6	47534	47539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113330
1098	NC_015179	TGG	2	6	47547	47552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113330
1099	NC_015179	TGC	2	6	47610	47615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113330
1100	NC_015179	CG	3	6	47755	47760	0 %	0 %	50 %	50 %	325113330
1101	NC_015179	GCT	2	6	47761	47766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113330
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1103	NC_015179	TGG	2	6	47791	47796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113330
1104	NC_015179	TG	3	6	47808	47813	0 %	50 %	50 %	0 %	325113330
1105	NC_015179	GCA	2	6	47842	47847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113330
1106	NC_015179	GC	3	6	47863	47868	0 %	0 %	50 %	50 %	325113330
1107	NC_015179	GCG	2	6	47881	47886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113330
1108	NC_015179	CGCTC	2	10	47924	47933	0 %	20 %	20 %	60 %	325113330
1109	NC_015179	AGC	2	6	47934	47939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113330
1110	NC_015179	TGC	2	6	47943	47948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113330
1111	NC_015179	GCT	2	6	47993	47998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113330
1112	NC_015179	TGC	2	6	48011	48016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113330
1113	NC_015179	TCAC	2	8	48030	48037	25 %	25 %	0 %	50 %	325113330
1114	NC_015179	CGG	2	6	48045	48050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113330
1115	NC_015179	CGG	2	6	48065	48070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113330
1116	NC_015179	AGCTG	2	10	48133	48142	20 %	20 %	40 %	20 %	325113330
1117	NC_015179	TCGCGA	2	12	48151	48162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325113330
1118	NC_015179	CCA	2	6	48226	48231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113330
1119	NC_015179	CTA	2	6	48308	48313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_015179	GCG	2	6	48419	48424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113331
1121	NC_015179	TGT	2	6	48429	48434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325113331
1122	NC_015179	CGG	2	6	48435	48440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113331
1123	NC_015179	GCT	2	6	48510	48515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113331
1124	NC_015179	CGC	2	6	48531	48536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113331
1125	NC_015179	GAA	2	6	48565	48570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113331
1126	NC_015179	GCG	2	6	48627	48632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113331
1127	NC_015179	AGC	2	6	48773	48778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113332
1128	NC_015179	GCG	2	6	48811	48816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113332
1129	NC_015179	GCA	2	6	48884	48889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113332
1130	NC_015179	TGCG	2	8	48895	48902	0 %	25 %	50 %	25 %	325113332
1131	NC_015179	TCG	2	6	48928	48933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113332
1132	NC_015179	AC	3	6	48934	48939	50 %	0 %	0 %	50 %	325113332
1133	NC_015179	GC	3	6	48948	48953	0 %	0 %	50 %	50 %	325113332
1134	NC_015179	GC	3	6	49024	49029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_015179	CGC	2	6	49032	49037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_015179	GCT	2	6	49067	49072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_015179	TCC	2	6	49086	49091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1150	NC_015179	CGC	2	6	49775	49780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1151	NC_015179	GCC	2	6	49792	49797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1152	NC_015179	CAT	2	6	49822	49827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113334
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1163	NC_015179	A	6	6	50181	50186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_015179	T	6	6	50188	50193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_015179	TAC	2	6	50222	50227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1166	NC_015179	CG	3	6	50259	50264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1167	NC_015179	TTG	2	6	50451	50456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_015179	AGG	2	6	50477	50482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_015179	A	6	6	50514	50519	100 %	0 %	0 %	0 %	325113335
1170	NC_015179	CG	3	6	50547	50552	0 %	0 %	50 %	50 %	325113335
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1191	NC_015179	GCCC	2	8	51575	51582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1192	NC_015179	TGCCC	2	10	51608	51617	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1193	NC_015179	GCC	2	6	51620	51625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1196	NC_015179	GTCGCT	2	12	51810	51821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1198	NC_015179	GCT	2	6	51956	51961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1199	NC_015179	GCA	2	6	51990	51995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1232	NC_015179	GAA	2	6	53777	53782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1233	NC_015179	CGAA	2	8	53797	53804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1234	NC_015179	GCC	2	6	53858	53863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113338
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1240	NC_015179	GA	3	6	54034	54039	50 %	0 %	50 %	0 %	325113338
1241	NC_015179	CAG	2	6	54047	54052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113338
1242	NC_015179	CGGG	2	8	54082	54089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1243	NC_015179	GTG	2	6	54114	54119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_015179	T	6	6	54169	54174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_015179	CTG	2	6	54196	54201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_015179	GGA	2	6	54238	54243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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